Открываем порт в iptables для IP с которого будем делать подключение:
-A INPUT -i eth0 -s 10.0.1.3 -p tcp --destination-port 3306 -j ACCEPT
Откроем удаленный доступ к БД с именем remdb:
1. Создадим юзера webmin со всеми привелегиями через которого будем конектиться и дадим ему на это права:
$ mysql -u root -p
GRANT ALL PRIVILEGES ON remdb.* TO 'webmin'@'10.0.1.3' IDENTIFIED BY 'пароль_webmina' WITH GRANT OPTION;
тут вместо ip адреса 10.0.1.3 с которого будем подключаться, можно указать % и это позволить этому пользователю подключаться с любого ip адреса, но уже необходимо снимать ограничения по ip в iptables. Чтобы разрешить пользователю подключаться к любым базам, то где remdb.* нужно *.*, что не безопасно.
Можно также изменить существующего юзера:
$ mysql -u root -p mysql
mysql> update db set Host='10.0.1.3' where Db='remdb';
mysql> update user set Host='10.0.1.3' where user='webmin';
Если не удается подключиться, то в файле /etc/mysql/my.cnf, по умолчанию, разрешены подключение только к локальному хосту:
bind-address = 127.0.0.1
прописываем адрес машины под которой запущен MySQL:
bind-address = 10.0.1.3
либо
bind-address = 0.0.0.0
чтобы MySQL слушал на всех сетевых интерфейсах (eth0, lo, …), перезапускаем mysql:
# service mysqld restart